MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia cenocepacia MC0-3 chromosome 2

Total Repeats: 81420

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010515	CGG	2	6	41	46	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170735572
2	NC_010515	GGTA	2	8	58	65	25 %	25 %	50 %	0 %	170735572
3	NC_010515	CGA	2	6	172	177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170735572
4	NC_010515	GTA	2	6	251	256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170735572
5	NC_010515	GCT	2	6	281	286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170735572
6	NC_010515	GCCT	2	8	383	390	0 %	25 %	25 %	50 %	170735572
7	NC_010515	CGG	2	6	457	462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170735572
8	NC_010515	TCGC	2	8	744	751	0 %	25 %	25 %	50 %	170735573
9	NC_010515	GGC	2	6	795	800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170735573
10	NC_010515	GCCA	2	8	832	839	25 %	0 %	25 %	50 %	170735573
11	NC_010515	AGC	2	6	841	846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170735573
12	NC_010515	CGC	2	6	852	857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170735573
13	NC_010515	TGA	2	6	887	892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170735573
14	NC_010515	CGG	2	6	957	962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170735573
15	NC_010515	GAA	2	6	969	974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170735573
16	NC_010515	GC	3	6	994	999	0 %	0 %	50 %	50 %	170735573
17	NC_010515	GCCT	2	8	1063	1070	0 %	25 %	25 %	50 %	170735573
18	NC_010515	GCC	2	6	1072	1077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170735573
19	NC_010515	CG	3	6	1274	1279	0 %	0 %	50 %	50 %	170735573
20	NC_010515	TTG	2	6	1396	1401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170735573
21	NC_010515	CGT	2	6	1412	1417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170735573
22	NC_010515	GAA	2	6	1443	1448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170735573
23	NC_010515	CAC	2	6	1449	1454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170735573
24	NC_010515	GCGG	2	8	1472	1479	0 %	0 %	75 %	25 %	170735573
25	NC_010515	TCG	2	6	1510	1515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170735573
26	NC_010515	TGA	2	6	1526	1531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170735573
27	NC_010515	GAT	2	6	1614	1619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170735573
28	NC_010515	TCG	2	6	1624	1629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170735573
29	NC_010515	GCG	2	6	1641	1646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170735573
30	NC_010515	TGA	2	6	1727	1732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170735573
31	NC_010515	GAT	2	6	1839	1844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170735573
32	NC_010515	TTG	2	6	1849	1854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170735573
33	NC_010515	TCGG	2	8	1879	1886	0 %	25 %	50 %	25 %	170735573
34	NC_010515	CAG	2	6	1914	1919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170735573
35	NC_010515	TCT	2	6	1982	1987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170735573
36	NC_010515	GCC	2	6	2653	2658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170735574
37	NC_010515	CCCG	2	8	2668	2675	0 %	0 %	25 %	75 %	170735574
38	NC_010515	TGA	2	6	2739	2744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170735574
39	NC_010515	TCG	2	6	2804	2809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170735574
40	NC_010515	GC	3	6	2842	2847	0 %	0 %	50 %	50 %	170735574
41	NC_010515	CG	3	6	2852	2857	0 %	0 %	50 %	50 %	170735574
42	NC_010515	CG	3	6	2876	2881	0 %	0 %	50 %	50 %	170735574
43	NC_010515	TCG	2	6	2883	2888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170735574
44	NC_010515	CCG	2	6	2891	2896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170735574
45	NC_010515	CGA	2	6	2914	2919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170735574
46	NC_010515	CG	3	6	2963	2968	0 %	0 %	50 %	50 %	170735574
47	NC_010515	GGCC	2	8	3040	3047	0 %	0 %	50 %	50 %	170735574
48	NC_010515	CG	3	6	3051	3056	0 %	0 %	50 %	50 %	170735574
49	NC_010515	TCG	2	6	3129	3134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170735574
50	NC_010515	GCG	2	6	3196	3201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170735574
51	NC_010515	GATG	2	8	3205	3212	25 %	25 %	50 %	0 %	170735574
52	NC_010515	CG	3	6	3218	3223	0 %	0 %	50 %	50 %	170735574
53	NC_010515	TCG	2	6	3225	3230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170735574
54	NC_010515	CGG	2	6	3286	3291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170735574
55	NC_010515	CGC	2	6	3292	3297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170735574
56	NC_010515	CGC	2	6	3333	3338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170735574
57	NC_010515	CTG	2	6	3450	3455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170735575
58	NC_010515	CGG	2	6	3488	3493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170735575
59	NC_010515	GCG	2	6	3538	3543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170735575
60	NC_010515	CG	4	8	3542	3549	0 %	0 %	50 %	50 %	170735575
61	NC_010515	GCC	2	6	3599	3604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170735575
62	NC_010515	CCGG	2	8	3612	3619	0 %	0 %	50 %	50 %	170735575
63	NC_010515	GCC	2	6	3657	3662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170735575
64	NC_010515	CGG	2	6	3698	3703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170735575
65	NC_010515	CAA	2	6	3719	3724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170735575
66	NC_010515	CGG	2	6	3746	3751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170735575
67	NC_010515	CGA	2	6	3755	3760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170735575
68	NC_010515	CGC	2	6	3825	3830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170735575
69	NC_010515	GCT	2	6	3839	3844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170735575
70	NC_010515	CGG	2	6	3860	3865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170735575
71	NC_010515	ATC	2	6	3870	3875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170735575
72	NC_010515	GTC	2	6	3881	3886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170735575
73	NC_010515	GCCG	2	8	3891	3898	0 %	0 %	50 %	50 %	170735575
74	NC_010515	CCA	2	6	3931	3936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170735575
75	NC_010515	GGT	2	6	3944	3949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170735575
76	NC_010515	CG	4	8	4057	4064	0 %	0 %	50 %	50 %	170735575
77	NC_010515	CAG	2	6	4065	4070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170735575
78	NC_010515	ACG	2	6	4084	4089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170735575
79	NC_010515	AGC	2	6	4096	4101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170735575
80	NC_010515	GCG	2	6	4124	4129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170735575
81	NC_010515	CGC	2	6	4151	4156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170735575
82	NC_010515	CGGG	2	8	4180	4187	0 %	0 %	75 %	25 %	170735575
83	NC_010515	TCA	3	9	4296	4304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170735576
84	NC_010515	CGC	2	6	4362	4367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170735576
85	NC_010515	CGGCG	2	10	4405	4414	0 %	0 %	60 %	40 %	170735576
86	NC_010515	CCTGCA	2	12	4417	4428	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	170735576
87	NC_010515	CGCA	2	8	4429	4436	25 %	0 %	25 %	50 %	170735576
88	NC_010515	GACG	2	8	4507	4514	25 %	0 %	50 %	25 %	170735576
89	NC_010515	GGC	2	6	4535	4540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170735576
90	NC_010515	CGA	2	6	4558	4563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170735576
91	NC_010515	CGT	2	6	4602	4607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170735576
92	NC_010515	GCG	2	6	4758	4763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170735576
93	NC_010515	TCG	2	6	4827	4832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170735576
94	NC_010515	GCC	2	6	4849	4854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170735576
95	NC_010515	TTC	2	6	4856	4861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170735576
96	NC_010515	CGG	2	6	4885	4890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170735576
97	NC_010515	GC	3	6	4896	4901	0 %	0 %	50 %	50 %	170735576
98	NC_010515	GGA	2	6	4906	4911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170735576
99	NC_010515	CGA	2	6	5004	5009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170735576
100	NC_010515	GCCG	2	8	5152	5159	0 %	0 %	50 %	50 %	170735576
101	NC_010515	GC	4	8	5162	5169	0 %	0 %	50 %	50 %	170735576
102	NC_010515	TCA	2	6	5441	5446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170735577
103	NC_010515	GTC	2	6	5459	5464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170735577
104	NC_010515	CGC	2	6	5465	5470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170735577
105	NC_010515	GCT	2	6	5498	5503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170735577
106	NC_010515	GCT	2	6	5522	5527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170735577
107	NC_010515	CGC	2	6	5531	5536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170735577
108	NC_010515	TCG	2	6	5610	5615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170735577
109	NC_010515	TTCT	2	8	5643	5650	0 %	75 %	0 %	25 %	170735577
110	NC_010515	GC	4	8	5701	5708	0 %	0 %	50 %	50 %	170735577
111	NC_010515	GC	3	6	5740	5745	0 %	0 %	50 %	50 %	170735577
112	NC_010515	GTCG	2	8	5747	5754	0 %	25 %	50 %	25 %	170735577
113	NC_010515	GCG	2	6	5770	5775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170735577
114	NC_010515	CGT	2	6	5779	5784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170735577
115	NC_010515	CTG	2	6	5799	5804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170735577
116	NC_010515	GAG	2	6	5871	5876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170735577
117	NC_010515	GC	4	8	5880	5887	0 %	0 %	50 %	50 %	170735577
118	NC_010515	TCG	2	6	5926	5931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170735577
119	NC_010515	GC	3	6	5947	5952	0 %	0 %	50 %	50 %	170735577
120	NC_010515	TGGC	2	8	5984	5991	0 %	25 %	50 %	25 %	170735577
121	NC_010515	TCG	3	9	6001	6009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170735577
122	NC_010515	TCG	2	6	6037	6042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170735577
123	NC_010515	GCGCC	2	10	6070	6079	0 %	0 %	40 %	60 %	170735577
124	NC_010515	CG	3	6	6102	6107	0 %	0 %	50 %	50 %	170735577
125	NC_010515	GGC	2	6	6122	6127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170735577
126	NC_010515	CGC	2	6	6146	6151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170735577
127	NC_010515	CGG	2	6	6155	6160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170735577
128	NC_010515	CCA	2	6	6224	6229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170735577
129	NC_010515	TCT	2	6	6250	6255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170735577
130	NC_010515	CAT	2	6	6266	6271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170735577
131	NC_010515	GGC	2	6	6283	6288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170735577
132	NC_010515	CGGTCG	2	12	6295	6306	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	170735577
133	NC_010515	CGC	3	9	6332	6340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170735577
134	NC_010515	TG	3	6	6400	6405	0 %	50 %	50 %	0 %	170735577
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262	NC_010515	GCG	2	6	11641	11646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170735581
263	NC_010515	GGC	2	6	11778	11783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170735582
264	NC_010515	CG	4	8	11822	11829	0 %	0 %	50 %	50 %	170735582
265	NC_010515	ATC	2	6	11830	11835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170735582
266	NC_010515	GC	4	8	11846	11853	0 %	0 %	50 %	50 %	170735582
267	NC_010515	CGA	2	6	11885	11890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170735582
268	NC_010515	GCG	2	6	11892	11897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170735582
269	NC_010515	TCT	2	6	11924	11929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170735582
270	NC_010515	CGAG	2	8	11957	11964	25 %	0 %	50 %	25 %	170735582
271	NC_010515	GCA	2	6	11999	12004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170735582
272	NC_010515	GCGA	2	8	12037	12044	25 %	0 %	50 %	25 %	170735582
273	NC_010515	CGG	2	6	12047	12052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170735582
274	NC_010515	GCG	2	6	12163	12168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170735582
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277	NC_010515	CGAGC	2	10	12240	12249	20 %	0 %	40 %	40 %	170735582
278	NC_010515	CGA	2	6	12279	12284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170735582
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280	NC_010515	GCGACA	2	12	12338	12349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170735582
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282	NC_010515	TGA	2	6	12409	12414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170735582
283	NC_010515	GCA	2	6	12440	12445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170735582
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285	NC_010515	GC	3	6	12464	12469	0 %	0 %	50 %	50 %	170735582
286	NC_010515	CTT	2	6	12479	12484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170735582
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290	NC_010515	TCA	2	6	12575	12580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170735582
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292	NC_010515	CG	4	8	12615	12622	0 %	0 %	50 %	50 %	170735582
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294	NC_010515	GCG	3	9	12655	12663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170735582
295	NC_010515	CGA	2	6	12680	12685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170735582
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300	NC_010515	GAC	2	6	13125	13130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170735583
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302	NC_010515	TCG	2	6	13211	13216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170735583
303	NC_010515	GC	3	6	13217	13222	0 %	0 %	50 %	50 %	170735583
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343	NC_010515	GCTC	2	8	14555	14562	0 %	25 %	25 %	50 %	170735583
344	NC_010515	CCGG	2	8	14603	14610	0 %	0 %	50 %	50 %	170735583
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352	NC_010515	TCGA	2	8	14869	14876	25 %	25 %	25 %	25 %	170735583
353	NC_010515	GAAC	2	8	14886	14893	50 %	0 %	25 %	25 %	170735583
354	NC_010515	CTT	2	6	14901	14906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170735583
355	NC_010515	CGA	2	6	14907	14912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170735583
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358	NC_010515	GCACA	2	10	14971	14980	40 %	0 %	20 %	40 %	170735583
359	NC_010515	CG	3	6	15009	15014	0 %	0 %	50 %	50 %	170735583
360	NC_010515	GCA	2	6	15017	15022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170735583
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362	NC_010515	GC	3	6	15059	15064	0 %	0 %	50 %	50 %	170735583
363	NC_010515	GAA	2	6	15104	15109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170735583
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368	NC_010515	GCC	2	6	15620	15625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170735585
369	NC_010515	GC	3	6	15654	15659	0 %	0 %	50 %	50 %	170735585
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374	NC_010515	CGA	2	6	15755	15760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170735585
375	NC_010515	GTT	2	6	15780	15785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170735585
376	NC_010515	GGT	2	6	15801	15806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170735585
377	NC_010515	GC	3	6	15809	15814	0 %	0 %	50 %	50 %	170735585
378	NC_010515	TGC	2	6	15818	15823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170735585
379	NC_010515	CGC	2	6	15831	15836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170735585
380	NC_010515	CGC	2	6	15878	15883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170735585
381	NC_010515	GCC	3	9	15897	15905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170735585
382	NC_010515	CG	3	6	15927	15932	0 %	0 %	50 %	50 %	170735585
383	NC_010515	GCA	2	6	15959	15964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170735585
384	NC_010515	GTCG	2	8	15972	15979	0 %	25 %	50 %	25 %	170735585
385	NC_010515	GAC	2	6	15987	15992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170735585
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388	NC_010515	GC	3	6	16124	16129	0 %	0 %	50 %	50 %	170735585
389	NC_010515	GCC	2	6	16140	16145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170735585
390	NC_010515	CG	3	6	16163	16168	0 %	0 %	50 %	50 %	170735585
391	NC_010515	GCC	2	6	16182	16187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170735585
392	NC_010515	GCC	3	9	16215	16223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170735585
393	NC_010515	CGC	2	6	16226	16231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170735585
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494	NC_010515	CAGG	2	8	20171	20178	25 %	0 %	50 %	25 %	170735589
495	NC_010515	TGCCGT	2	12	20179	20190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170735589
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498	NC_010515	CCG	2	6	20331	20336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170735589
499	NC_010515	CGC	2	6	20356	20361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170735589
500	NC_010515	CGA	3	9	20368	20376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170735589

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